毕节市疾病预防控制中心前身为毕节地区卫生防疫站，成立于1958年，2012年正式更名，为毕节市卫生健康局直属财政全额预算管理的正县级事业单位。中心现有国家财政拨款修建的业务办公综合楼1幢，建筑面积3216平方米，总投资390万元人民币，是2005年5月建成投入使用的，另有其它辅助用房1200平方米。毕节市疾病预防中心建设项目已纳入2017年市委市政府10件民生实事，总建筑面积10400余平方米，概算投资9941.16万元(含实验室设备添置)，其中获得中央2016年补助资金1500万。项目已于2017年3月22日正式动工，房屋主体工程于2018年完工，其余部分工程正在积极推进，项目建成后，中心房屋面积将完全达标。

机构内设办公室、总务科、流行病科、慢性病科、职业病防治科、卫生监测科、健教信息科、检验科、艾滋病性病防治科、公共卫生事件应急办公室共2室8科。

中心主要工作职能为：拟定全市重大传染病、地方病、免疫接种规划、职业病防治等技术规范工作计划并组织实施；负责健康相关危害因素监测、流行病学调查检测、评价、科研、培训和咨询工作；指导参与全市基本公共卫生服务、健康教育宣传与促进以及行为干预工作；负责建立和完善市级疾病预防控制和公共卫生信息网络及相关信息的收集、整理、统计分析、综合评价、反馈及疫情预测和报告等工作；指导和承担全市重大疾病、中毒、卫生污染、救灾防病等重大公共卫生问题的调查并提出控制措施，负责疫点、疫区消毒指导及卫生学评价；负责对下级疾病预防控制机构人员的业务指导培训工作。