新会海关是受江门海关直接领导，按授权负责江门市新会区开放口岸和新会区内海关各类管理工作的执行机构。主要负责党的基层组织建设和干部队伍建设；办理具体海关业务，反馈执法作业结果；完成江门海关交办的其他工作。
机构设置：办公室（党委办公室）、人事政工党廉科（党委组织宣传部）、行财科、综合业务一科、企业管理科、稽查科、核查科、查检一科、查检二科，新会海关驻新会港办事处。
