国家税务总局海口市琼山区税务局于2018年7月20日挂牌，承继原海口市琼山区国家税务局、海南省海口市琼山区地方税务局税费征管的职责和工作，启用新的行政、业务印章，以新税务机构的名称开展工作。原海口市琼山区国家税务局、海南省海口市琼山区地方税务局的行政、业务印章停止使用。
国家税务总局海口市琼山区税务局办公地址：海口市琼山区凤翔西路22号，邮政编码：571199。
自2018年7月20日起，原海口市琼山区国家税务局第一税务分局、海口市琼山区国家税务局第二税务分局、海口市琼山区国家税务局第三税务分局、海口市琼山区国家税务局第四税务分局暂以国家税务总局海口市琼山区税务局名称对外开展业务工作，原有行政、业务印章停止使用。
国家税务总局海口市琼山区税务局的主要职责是：
(一)负责贯彻执行党的路线、方针、政策，加强党的全面领导，履行全面从严治党责任，负责党的建设和思想政治建设工作。
(二)负责贯彻执行税收、社会保险费和有关非税收入法律、法规、规章和规范性文件，研究制定具体实施办法。组织落实国家规定的税收优惠政策。
(三)负责本单位税收、社会保险费和有关非税收入的会统核算工作。组织开展收入分析预测。
(四)负责开展税收经济分析和税收政策效应分析，为国家税务总局、省税务局和市委、市政府提供决策参考。
(五)负责所辖区域内各项税收、社会保险费和有关非税收入征收管理。组织实施税(费)源监控和风险管理，加强大企业和自然人税收管理。
(六)负责组织实施本单位税收、社会保险费和有关非税收入服务体系建设。组织开展纳税服务、税收宣传工作，保护纳税人、缴费人合法权益。承担涉及税收、社会保险费和有关非税收入的行政处罚听证、行政复议和行政诉讼事项。
(七)负责所辖区域内国际税收和进出口税收管理工作，组织反避税调查和出口退税事项办理。
(八)负责组织实施所辖区域内税务稽查和社会保险费、有关非税收入检查工作。
(九)负责增值税专用发票、普通发票和其他各类发票管理。负责税收、社会保险费和有关非税收入票证管理。
(十)负责组织实施本单位各项税收、社会保险费和有关非税收入征管信息化建设和数据治理工作。
(十一)负责本单位内部控制机制建设工作，开展对本单位贯彻执行党中央、国务院重大决策及上级工作部署情况的督查督办，组织实施税收执法督察。
(十二)负责本单位基层建设和干部队伍建设工作，加强领导班子和后备干部队伍建设，承担税务人才培养和干部教育培训工作。负责本单位绩效管理和干部考核工作。
(十三)负责本单位机构、编制、经费和资产管理工作。
(十四)完成国家税务总局、省税务局和市委、市政府交办的其他工作。