对于在第二点所述的第1、2种情况下，注销税务登记是否要进行企业所得税的清算，财税〔2009〕60号文件第二条进行了明确：
(一)按《公司法》、《企业破产法》等规定需要进行清算的企业。
(二)企业重组中需要按清算处理的企业。
按《公司法》、《企业破产法》等规定需要进行清算的主要包括以下几种类型：
1.企业解散。合资、合作、联营企业在经营期满后，不再继续经营而解散；合作企业的一方或多方违反合同、章程而提前终止合作关系解散的。
2.企业破产。企业资不抵债，按《破产法》进行清算的。
3.其他原因清算。企业因自然灾害、战争等不可抗力遭受损失，无法经营下去，应进行清算；企业因违法经营，造成环境污染或危害社会公众利益，被停业、撤销，应当进行清算的。
企业重组中需要进行企业所得税清算的，依照财政部、国家税务总局《关于企业重组业务企业所得税处理若干问题的通知》(财税〔2009〕59号)规定，主要包括以下4种类型：
1.企业由法人转变为个人独资企业、合伙企业等非法人组织的。
2.企业将登记注册地转移至中华人民共和国境外(包括港澳台地区)的。
3.不适用特殊性税务处理的企业合并中，被合并企业及其股东都应按清算进行所得税处理。
4.不适用特殊性税务处理的企业分立中，被分立企业不再继续存在时，被分立企业及其股东都应按清算进行所得税处理。
