机构职能：广州白云机场海关是受广州海关直接领导，按授权负责广州白云机场口岸范围内海关各类管理工作的副厅级隶属海关，主要负责党的基层建设和干部队伍建设；办理具体海关业务，反馈执法作业结果；完成广州海关交办的其他工作。

机构设置：办公室（党委办公室）、人事政工处（党委组织宣传部）、财务装备处、审核业务处、物流监控处、查验一处、查验二处、旅检一处、旅检二处、值机处、驻跨境电商监管中心办事处。