黄岛海关是受青岛海关直接领导，按授权负责指定口岸和区域范围内海关各类管理工作的执行机构。主要负责党的基层组织建设和干部队伍建设；办理具体海关业务，反馈执法作业结果；完成青岛海关交办的其他工作。

概况：2003年5月，经国务院批准，中华人民共和国黄岛海关正式成立。管辖范围为青岛市黄岛区（青岛西海岸新区）（董家口港区除外）的各项海关管理工作。现有关警员690余人。

2005-2019年黄岛海关始终保持“山东省省级文明单位”称号，2019年报关大厅获评全国青年文明号；2020年舱单管理科党支部获评全国海关基层党建示范品牌。2018、2019年度在青岛市经济社会发展综合考核中均为优秀等次，并获评“青岛关区2019年度工作优秀集体”。

内设机构：办公室（党委办公室）、人事政工处（党委组织宣传部）、财务保障处、综合业务一处、综合业务二处、企业管理处、口岸监管处、查检一处、查检二处、稽查处。

事业单位：综合技术服务中心。