延吉海关是受长春海关直接领导,按授权负责指定口岸和区域范围内海关各类管理工作的执行机构。主要负责党的基层组织建设和干部队伍建设;办理具体海关业务,反馈执法作业结果;完成长春海关交办的其他工作。
机构规格为正处级,机构类型为偏口岸综合型,管辖范围为:负责延边州行政区划内的属地和口岸相关海关业务(按有关规定实施集约化管理的审批备案业务和稽查业务除外,珲春市、安图县行政区划内的属地和口岸相关海关业务除外,图们市、龙井市行政区划内的口岸相关海关业务除外)。
内设机构
延吉海关设下列21个正科级内设机构:办公室(党委办公室)、人事政工科(党委组织宣传部)、综合保障科、综合业务一科、综合业务二科、监管一科、监管二科、企业管理科、稽查科、核查科、风险监控科、邮局监管一科、邮局监管二科、南坪口岸综合业务科、南坪口岸监管科、古城里口岸综合业务科、古城里口岸监管科、快件综合业务科、快件监管科、保税物流中心监管科、敦化监管科。
派驻机构
延吉海关驻机场办事处下设5个正科级内设机构:驻机场办事处综合业务科、驻机场办事处监管科、驻机场办事处旅检一科、驻机场办事处旅检二科、驻机场办事处旅检三科。