舟山海关是隶属于杭州海关的国家进出境监督管理机关，管辖舟山市（除嵊泗县以外）的各项海关管理工作。基本任务是进出境监管、征收关税和其他税费、查缉走私、出入境检验检疫、编制海关统计，并承担口岸管理、保税监管、海关稽查、知识产权海关保护等职责。

单位概况：舟山海关成立于1988年4月，是我国首个设在群岛上并已正式开展业务的隶属海关。全关内设23个科室，下辖1个副处级办事处（舟山海关驻定海办事处），现有人员241人。舟山海关缉私分局成立于1999年1月，内设6个科室，现有人员23人。舟山海关业务管辖范围为定海区、普陀区、岱山县。辖区开放区域面积1344.8平方公里，共有实际运行的海关监管作业场所62家，保税监管场所25家，分布在18个大小岛屿及其周边海域上。口岸主要进口商品为原油、成品油、铁矿砂、煤炭、粮食等大宗货物，主要出口商品有成品油、船舶、水产品等。

机构设置：内设科室23个：办公室、法规科、综合业务一科、综合业务二科、综合业务三科、税收管理科、监管一科、监管二科、监管三科、监管四科、监管五科、监管六科、物流监控科、海上监管科、统计分析科、企业管理科、保税监管科、稽查科、财务科、科技科、督察内控科、人事教育科、政工科，下辖舟山海关驻定海办事处1个副处级办事处。舟山海关缉私分局内设办公室、政工科、侦查科、法制科、查私科、情报科等6个科室。